من أكثر أخطاء الشحن الجمركي الشائعة انتشارًا هي الأخطاء المتعلقة بالمستندات الجمركية، مثل الفواتير التجارية غير الدقيقة أو نقص بعض البيانات الأساسية في بوليصة الشحن أو اختلاف المعلومات بين المستندات المختلفة. هذه الأخطاء قد تبدو بسيطة لكنها تؤدي إلى تأخير كبير في عملية التخليص الجمركي، حيث تعتمد الجهات المختصة بشكل أساسي على صحة ودقة هذه المستندات لاتخاذ القرار المناسب بشأن الإفراج عن الشحنة أو فحصها.

كما أن أي اختلاف في بيانات مثل الوزن أو عدد القطع أو وصف البضائع قد يسبب مشاكل كبيرة أثناء الفحص الجمركي، وقد يؤدي في بعض الحالات إلى إعادة تقييم الرسوم الجمركية أو احتجاز الشحنة لحين تصحيح البيانات. لذلك يجب التأكد من مراجعة جميع المستندات بدقة شديدة قبل إرسال الشحنة، مع الاعتماد على خبراء أو أنظمة تدقيق لتجنب أي أخطاء قد تؤثر على سير العملية بالكامل وتسبب خسائر غير متوقعة.